concept
合成生物学による人工生命システムの創生により生命の起源から産業応用まで
合成生物学研究室木賀 大介 教授
担当科目:生化学、合成生物学、設計生物学
生命の情報と進化
concept
合成生物学による人工生命システムの創生により生命の起源から産業応用まで
合成生物学研究室木賀 大介 教授
担当科目:生化学、合成生物学、設計生物学
生命の情報と進化
今世紀に入ってからのゲノム解析の進展などによる生命情報の蓄積と、DNAなど生体高分子を合成する技術の進展とにより、生命の「部品」を組み合わせて新規なシステムを合成する、合成生物学が勃興しています。この組み合わせの場合の数が膨大なため、システムを効率よく合成するために、数理モデルの活用が重要になっています。さらに当研究室では、生命の共通規格である、20種類、というアミノ酸の数を変化させることで、生命の起源から新世代の生物工学までを追及しています。
本研究室では、以下の科学的・工学的な研究を進めていますが、絶対的な縛りではありません。本研究室を志望する皆さんが独自の問題意識を持って合成生物学、構成論的アプローチをとることを、研究室の運営者として応援したいと思います。
アミノ酸の種類が変化したタンパク質の人工進化
なぜアミノ酸の種類が20種類なのか、という生命の起源やアストロバイオロジー観点の疑問に答える科学的な興味の追求と、タンパク質工学への応用を行っています。
【バイオDX】細胞内における人工遺伝子回路の構築
ゲノム情報の蓄積と、DNA合成技術の進展により、複数の遺伝子を組み合わせた「人工遺伝子回路」を構築することが容易になってきました。ただし、遺伝子は「何をつくる」と「何時つくる」という2つの情報を持っています。タンパク質のアミノ酸配列を指定する前者は、もとの生物からのコピーが可能ですが、遺伝子間の相互作用を規定する後者は、私たちが制御系を設計しなくてはいけません。この制御システムを、つくることで理解する研究を、JSTさきがけの支援を受けて進め、その後JST CRESTや科研費新学術・学術変革などの枠組みの研究でより広く展開しています。
【DNAコンピュータ・生体高分子システムの作成】生命との親和性を持ったDNAコンピュータ
DNAコンピュータへの入力を、生命が産出する分子とします。また、このDNAコンピュータが出力するRNAをmRNAとしてタンパク質に変換します。将来は、病変部位の局所環境を察知してタンパク質製剤を作製するシステムを目指しています。